除了日益加重的成本问题，生鲜电商还面临着产品标准难以建立、用户市场尚未完全成熟等根本性难题。作为市场竞争力度最大的生鲜电商，近几年发展一直不如人意。
食品行业专家朱丹蓬认为，国内电商的并没有做到上、中、下游完整的商业模式，部分电商平台主要集中在中、下游发力，而忽略了上游产品的重要性。
但是果蔬生鲜的品类众多，消费者对产品包装、口味等因素的关注点不一致，使得品牌企业很难满足所有用户的需求。这种供应链上游难以实现的标准化正是阻碍生鲜电商扩展市场的一大难题。
此外，我国消费者对生鲜果蔬等产品的购买仍然主要依靠线下实体店、社区营销点等渠道，家庭中购买此类产品的成员也多是年长人群。因此生鲜电商虽然较多地吸引了CBD等区域的白领人群，但是无法保证他们长期频繁购买的稳定性。
而这些年轻的购买群体又谙熟电商间低价竞争的策略，往往挑选低价平台购买产品。一旦生鲜电商取消价格补贴，他们就会逃离平台，因此根本无法建立有效的用户粘性。而出现这一问题的原因还是由于用户消费市场尚未完全成熟。当生鲜电商失去有效用户的时候，除了倒闭之外没有第二条路了。
