通关便利化程度是跨境电商企业普遍关心的话题。根据《实施意见》，本市将创新监管模式，打造跨境电商综合服务平台，促进跨境电商规范化、阳光化、便利化运行。
在口岸通关环节，北京站、首都机场快件监管中心、国货航和国门商务区监管场所将提升运行效率，提供24小时便捷通关服务。同时，按照国际一流航空枢纽建设标准，科学规划新机场综保区跨境电子商务监管场所，提供集仓储、收寄、通关、结汇、报税等多功能于一体的“一站式”跨境电商综合服务，实现便利化通关。
在线上，北京跨境电子商务公共信息平台功能将得到完善拓展，提供海关通关、检验检疫、物流快递、结汇、缴纳进口税、出口退税、金融等环节的综合服务，实现与北京电子口岸平台的互联互通，打造北京跨境电子商务服务线上“单一窗口”，为跨境电子商务企业提供安全、高效、便捷、开放的公共服务，实现政府部门信息共享和有效监管。
此外，本市还将引导支持相关企业对接跨境电子商务公共信息平台，将跨境电子商务进出口数据纳入海关实时统计，探索通过跨境电子商务公共信息平台对接各监管部门业务系统，将跨境电子商务经营和服务主体、贸易规模、商品信息、结汇、出口退税等纳入专项统计，运用大数据手段开展跨境电子商务运行分析，为跨境电子商务实现科学化、规范化、协同化、可持续发展提供数据支撑。
