我国计算机技术在医疗机构得到应用起步于20世纪 80年代末，90年代初，这个阶段因为互联网尚未得到普及，医疗机构的数字化建设主要以单机版为主。

这一阶段的特点有三个： 功能单一、单机应用、信息孤岛。 这一阶段有一个比较有中国特色应用是用于临床诊疗的专家系统特别是中医专家系统风靡一时，后来因推理机制简单、缺乏自学习能力特别是缺乏临床信息系统支持等因素而逐渐退出。

90年代中期，随着局域网技术的成熟和使用，医院的信息化建设开始向网络化方向发展。这一阶段的主要特征是：网络投入使用、业务模式成型、信息局部共享、应用产生效益。

90年代后期，随着Windows网络操作系统、Oracle等大型数据库、计算机硬件的逐步成熟和对医疗信息化认识的逐步到位，医疗机构的信息化建设从局部应用向全院级应用发展。 这一阶段发展起来的HIS系统是我国医疗信息化发展史上的重要里程碑。

21世纪初，一些医院在全面实施HIS之后，开始逐步实施部分专业化的信息系统，医院信息化建设迈入HIS+专业信息系统阶段，直到现在，我国基本上还处于这个阶段。

国家新医改政策对医疗卫生信息化在整个医疗改革中的战略地位予以确认，《关于促进健康服务业发展的若干意见》、《国务院关于促进信息消费扩大内需的若干意见》和《关于加快推进人口健康信息化建设的指导意见》等一系列政策的出台，为信息技术在整个健康服务产业的应用创造了良好的政策环境。

2014年我国医疗信息化总花费规模为223.12亿元，2015年增长至243.60亿元，预计2020年我国医疗信息化总花费规模将达到430.01亿元，期间复合增长率为11.1%。2015-2016年度调查结果显示，三级医院中建设比例最高的是手术麻醉系统，达到31.04%，其次是临床决策支持系统达到27.16%;第三是远程医疗系统为26.57%。在三级以下医院中建设比例最高的是临床路径管理系统，达到33.62%;其次是体检中心管理系统，达到25.96%;第三是医院传染/感染监控系统，比例是25.53%。