尽管生鲜电商的市场前景被给予厚望，但这一领域依然问题丛生。首先是国内冷链物流能力的制约。生鲜产品在运输过程中需要不同温层冷冻冷藏，否则容易腐烂或影响产品品质。我国冷链物流行业基础差、起步晚，使得部分生鲜电商不得不尝试做自己的冷链物流，这些落后的基础设施制约了行业发展。

其次是产品同质化的风险。不少生鲜电商都有着共同的供货商，尽管有着服务上的细微差异，但同质化发展趋势仍不可避免。为了保证产品品质和差异化，生鲜电商们的产品采购不断向上游溯源。产地直采、自种自卖等形式也出现在人们的视线中，但这同时也带来了更大的管理和运营难度。

再者是资金压力。一方面，生鲜电商目前处于成长期，市场尚未形成定局。各家生鲜电商企业在市场培育、用户吸引等方面都需投入大量资金，以期抢占更多的用户资源、更大的市场份额。另一方面，为了做好品控，生鲜电商需要在货源、仓储、物流等方面也投入大量资金，这就使得生鲜电商在发展过程中承受巨大的资金压力。