三只松鼠出身线上，虽然部分避免了线下店铺的渠道成本，但事实上，在其成本支出方面并不乐观。
根据招股书显示，三只松鼠2014年和2015年毛利率分别为24.15%和26.93%，远低于同行业上市公司平均值则的43.06%和43.69%，毛利率是同行的60%。在报告期内，同期推广费分别为4178.82万元、8154.29万元和1.24亿元，占当期营业收入的比重为4.53%、3.99%和2.81%。
其毛利率较低的原因大概为：产品的规模效应远远不够，根据相关数据显示2014年国内休闲食品市场规模便已达3875亿元，其中坚果炒货占比23%，为891.25亿元，三只松鼠行业中占比仍然较低，还未享受规模化的低成本红利。
当毛利低于同类企业，而其所依赖的线上渠道又以“比价”为主要获客手段，三只松鼠的品牌溢价难以真正发挥作用，只能通过渠道多元化和产品多样性来稀释毛利过低的压力。
此前三支松鼠表示要进军线下渠道时，曾在舆论中掀起一轮热议。线上基因企业能否顺利实现线下化销售是大家关注的焦点。在铁哥看来，相比于线上，线下虽然店铺成本较高，但线下又是一个过分依赖“位置”的零售场景，在优秀的商圈和高客流量位置内，其运营毛利是可以有所保障的，这也是同类企业毛利远高于三只松鼠的重要原因。
但对于三只松鼠其线下征程的不确定性也相对较大，如坚果零食类产品的差异不大，基本是线上线下同款销售，这意味着线下渠道独立溢价的空间将进一步被压缩。这或许也是三只松鼠此前要以海购来实现分渠道销售的主要原因。
不仅三只松鼠，2016年裂帛的招股书中也表示要投入7000万开15家线下店。“淘品牌”的线下化运作，表面看是增加线下渠道的销量，但本质上还是希望通过多渠道建设提高产品毛利，以此提高产品全渠道的竞争力。
